PLAN DE L’ARTICLE
LA PRÉVALENCE ACTUELLE DES PATHOGÈNES RESPIRATOIRES CONNUS EN FRANCE
Encadré – La prévalence des virus respiratoires : synthèse de quelques études
Les données disponibles en France
Les nouvelles méthodes analytiques
Les résultats de deux études récentes
Tableau 1 – Fréquence de détection des agents pathogènes respiratoires obtenus par le LDA71 dans le cadre du diagnostic vétérinaire ou par l’INP-ENVT
Figure 1 – Répartition (%) des écouvillons nasaux et lavages broncho-alvéolaires en fonction du nombre de pathogènes détectés lors de l’étude 2
Les limites de ces études
VERS UNE CARACTÉRISATION DE NOUVEAUX VIRUS RESPIRATOIRES BOVINS ?
Figure 2 – Démarche méthodologique de la technique NGS appliquée aux prélèvements respiratoires bovins
Une approche ciblée : l’identification de l’Influenza virus D (IDV)
Aux États-Unis
En France
Tableau 2 – Caractérisation des six prélèvements français positifs pour l’influenza virus D
Dans les autres pays
Une approche exhaustive par NGS (next generation sequencing) : la caractérisation du “virome” respiratoire des bovines
Première étude sur la recherche du virome respiratoire des bovines
La deuxième étude sur des veaux
Figure 3 – Résultat d’un NGS sur un lavage broncho-alvéolaire avec identification de l’ensemble des séquences virales, notamment celles du VRSB, responsable du trouble respiratoire observé
Tableau 3 – Fréquence des agents infectieux détectés par PCR spécifiques chez 50 veaux atteints d’affections respiratoires et 50 veaux sains provenant des mêmes élevages
CONCLUSION
1 photo illustre cet article.
