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Résavip : approcher la diversité et la dynamique des virus influenza A circulant chez le Porc en France métropolitaine

Emmanuel Garin, Séverine Hervé, Nicolas Rose, Caroline Locatelli, David Ngwa-Mbot, Sébastien Wendling, Laure Bournez, Didier Calavas, Gaëlle Simon

N°34 - L'échographie un outil d'investigation, un outil d'investigation

Les virus Influenza porcins (VIPs) ont des capacités d’évolution importantes (mutation, délétion et réassortiment génétique) et de nouveaux virus peuvent également être introduits depuis l’étranger, ou à partir d’autres espèces, dont l’homme. Leur impact certain en santé animale et potentiel en santé publique rend leur surveillance nécessaire. Ainsi, depuis 2011, la France s’est dotée d’un réseau national de surveillance des VIPs, Résavip, qui permet d’approcher la diversité et la dynamique de ces virus en France métropolitaine. Son organisation se base sur un partenariat public-privé, une déclinaison opérationnelle régionale (animateur régional), des vétérinaires volontaires et s’inscrit dans le cadre de la Plateforme d’épidémiosurveillance en santé animale.

Entre 2011 et 2014, 900 visites d’élevages ont eu lieu dans 714 élevages localisés dans 30 départements.

La moitié (51,2 p. cent) de ces visites ont permis de détecter la présence de VIPs. Dans un peu plus de trois quarts de cas (357/465) un virus a pu être identifié. Le virus avian-like swine H1avN1 a été identifié le plus fréquemment (73,9 p. cent des cas), suivi par le virus human-like reassortant swine H1huN2 (21,3 p. cent).

D’autres virus ont été détectés de façon occasionnelle : le virus H1N1pdm (1,6 p. cent), le virus human-like reassortant swine H3N2 (0,6 p. cent) et un virus réassortant de nouvelle génération, le virus rH1avN2 (1,1 p. cent).

Dans cinq cas (1,4 p. cent) un mélange viral a été détecté.

Disciplines : Épidémiologie, Maladies contagieuses, Maladies infectieuses

Mots-clés : virus Influenza porcins, santé animale, santé publique, réseau, surveillance, Résavip, visites d’élevage, porc

PLAN DE L’ARTICLE
INTÉRÊTS DE LA SURVEILLANCE DES VIRUS INFLUENZA A CIRCULANT CHEZ LE PORC
Encadré – Les virus Influenza porcins détectés en France
Figure 1 – L’historique simplifié des virus Influenza porcins (VIPs) détectés en France
ORGANISATION ET FONCTIONNEMENT DE RÉSAVIP
Figure 2 – Logigramme présentant l’organisation de Résavip
La demarche lors de suspicion de grippe
RÉSULTATS DE LA SURVEILLANCE DE 2011 À 2014
Figure 3 – Répartition géographique des visites d’élevages* et des VIPs identifiés dans le cadre de Résavip entre 2011 et 2014
Tableau – Tableau présentant les résultats 2011-2014 issus de Résavip
Les virus enzootiques en Europe identifiés en France
La transmission au vison d’élevage
CONCLUSION

Garin E
Hervé S
Rose N

Nicolas Rose est docteur vétérinaire, membre du collège
Européen du management de la santé du porc (ECPHM)
et de santé publique vétérinaire (ECVPH)
1990 – 1994 : Etudes vétérinaires à l’école nationale vétérinaire de Nantes
1995 – 1998 : Ingénieur de recherche dans l’unité Epidémiologie – filière avicole (Cneva – Ploufragan)
2002 : Doctorat d’Université (Université Claude Bernard, Lyon 1)
1998 – 2012 : Ingénieur de recherche dans l’unité Epidémiologie – filière porcine (AFSSA puis Anses – laboratoire de Ploufragan)
Depuis 2012 : Chef de l’unité Epidémiologie et Bien-être du Porc (Anses – Laboratoire de Ploufragan)
Parcours

Calavas D

Didier Calavas
Chef de l’unité Epidémiologie à l’ANSES-Laboratoire de Lyon.
1976 : Diplôme de fin d’études vétérinaires, École nationale vétérinaire d’Alfort
1980 : Thèse de Doctorat vétérinaire, Université Paris Val de Marne, Créteil
1998 : Thèse d’université, spécialité Épidémiologie, Université Claude Bernard-Lyon
2006 : Habilitation à diriger des recherches (HDR), Université Claude Bernard-Lyon In 1
Autres expériences professionnelles :
Depuis 2003 : Chef de l’unité Epidémiologie du laboratoire de l’Afssa (puis de l’Anses), laboratoire de Lyon
2002-2011 : Directeur du laboratoire de l’Afssa (puis de l’Anses), laboratoire de Lyon
1997 – 2003 : Épidémiologiste Cneva, puis Afssa, laboratoire de Lyon
1991 – 1996 : Épidémiologiste, Centre d’écopathologie animale, Villeurbanne 1979 – 1991 : Vétérinaire Praticien