L’examen bactériologique est une étape souvent nécessaire, avant tout traitement antibiotique, pour confirmer ou infirmer un diagnostic dans les cas de maladies infectieuses chez le cheval.
La pertinence des résultats est fonction de la qualité du prélèvement effectué et des conditions de son acheminement. Leur interprétation est fonction des germes isolés (caractère pathogène, flore saprophyte …), de leur abondance au sein de l’échantillon ainsi que des commémoratifs cliniques (âge de l’animal, symptômes, contagiosité, nature de l’échantillon…).
Dans certains cas, pour aboutir à un diagnostic de certitude, des examens complémentaires sont nécessaires (cytologie, biologie moléculaire).
Depuis quelques années, les techniques de biologie moléculaire viennent compléter l’examen bactériologique.
Elles permettent de caractériser la virulence des souches isolées tout en contribuant au suivi épidémiologique des souches d’un élevage et à l’étude de l’évolution des antibiorésistances.
Toutefois, même si ces techniques sont plus sensibles et plus rapides que l’examen bactériologique classique, elles ne doivent pas être utilisées seules car l’isolement d’une souche bactérienne est un préalable indispensable à la réalisation d’antibiogrammes, seuls garants d’une antibiothérapie ciblée et adaptée limitant l’émergence de bactéries multirésistantes.
Disciplines : Diagnostic, bactériologie, malaise infectieuses, thérapeutique
Mots clés : résultats, prélèvement,
germes, cytologie, biologie moléculaire, examen bactériologique
LES EXAMENS À EFFECTUER SELON LE TYPE D’AFFECTION
Les examens lors d’affections respiratoires
Les examens lors d’affections digestives
Les examens lors d’affections génitales
Les métrites
Les avortements
Les examens lors d’autres affections
Les affections cutanées
L’arthrite septique
Les affections oculaires
Figure : La démarche de l’examen bactériologique
Tableau 1 : Les principaux germes retrouvés dans les maladies infectieuses du cheval
Tableau 2 : Conditions de prélèvement et d’acheminement lors de la recherche de Taylorella equigenitalis, agent responsable de la métrite contagieuse équine
LES APPORTS DE LA BIOLOGIE MOLÉCULAIRE
La détection directe des bactéries dans les prélèvements biologiques
L’identification moléculaire d’une bactérie isolée en culture
Le génotypage des souches bactériennes isolées à des fins épidémiologiques
La recherche de gènes et de mutations associés à des mécanismes de résistance aux antibiotiques
CONCLUSION