| | DOSSIER :
LES MYCOPLASMOSES
CHEZ LES RUMINANTS
LES ENTÉROCOQUES
DANS LA FILIÈRE VOLAILLE | | | | 1 | DOSSIER : Les mycoplasmoses chez les ruminants
résumé et plan de l'article
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Les principales évolutions
dans la connaissance des mycoplasmes
des ruminants
conséquences en matière de diagnostic
et de surveillance
Florence Tardy, Patrice Gaurivaud, Chloé Ambroset, Xavier Nouvel, Christine Citti
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Les mycoplasmes sont des bactéries particulières, sans paroi, de tailles cellulaire et génomique réduites. Parmi les 133 espèces de mycoplasmes répertoriées à ce jour, près d’un cinquième sont isolées chez les ruminants qu’elles soient commensales ou pathogènes. Ces dernières sont responsables essentiellement de pneumopathies, mammites et arthrites et quelques autres signes cliniques moins fréquents.
Ces dix dernières années, le séquençage des génomes et les analyses de génomiques comparées (entre espèces et entre souches d’une même espèce) ont apporté des connaissances nouvelles en termes de pouvoir pathogène, d’évolution, de transferts de gènes et de mécanismes génétiques responsables de la résistance aux antibiotiques.
D’un point de vue pratique, ces connaissances nouvelles ont conduit à :
- réviser la taxonomie ;
- mettre en évidence la nécessité de revalider régulièrement les techniques diagnostiques qui pourraient être remises en question par l’importante plasticité génomique des mycoplasmes ;
- et valider certaines techniques de sous-typage des souches pour la surveillance des maladies et la compréhension de leur histoire évolutive.
La diversification des souches par l’expression de divers polysaccharides capsulaires ou extracellulaires apportent une difficulté supplémentaire d’un point de vue diagnostique mais également pour comprendre les interactions avec l’hôte animal. Dans ce contexte, encore très exploratoire, des outils comme le réseau VIGIMYC sont précieux pour constituer des échantillons représentatifs de la diversité et de l’évolution des mycoplasmes.
Disciplines : Infectiologie, microbiologie
Mots-clés : mycoplasmes, évolution, diagnostic et surveillance, plasticité génomique, taxonomie, bovins, ovins, caprins, ruminants
PLAN DE L'ARTICLE
Encadré 1 - Rappels biologiques
Tableau 1 - Liste des espèces mycoplasmiques isolées chez les ruminants, connues à ce jour
LES GRANDES AVANCÉES SCIENTIFIQUES
Le séquençage des génomes permet de mieux connaître les mycoplasmes
Figure 1 - En bref, les grandes nouveautés depuis 2006
Encadré 2 - Principe des principales méthodes de sous-typage moléculaire des mycoplasmes
Des applications pratiques
Encadré 3 - Une capacité de conjugaison et de recombinaison homologue
Figure 2 - La cellule mycoplasmique, son contenu génomique et les transferts de gènes
Le décryptage des transferts horizontaux de gènes (THG)
Les mycoplasmes comme modèle de cellule minimale et biologie de synthèse
La diversification par les polysaccharides capsulaires (CPS) ou extra cellulaires (EPS)
LES CONSÉQUENCES DES DERNIÈRES AVANCÉES SCIENTIFIQUES SUR LE DIAGNOSTIC ET LA SURVEILLANCE ÉPIDÉMIOLOGIQUE
Encadré 4 - Capsule de polymères de sucre et expolymères
Tableau 2 - Évolutions de la taxonomie du groupe M. mycoide
La taxonomie revisitée
Le diagnostic des hémoplasmes
Encadré 5 - La révision de la taxonomie : conséquences pratiques sur le diagnostic
Les nécessaires mises à jour régulières des méthodes diagnostiques
Un besoin de méthodes de sous-typage pour la surveillance
La surveillance de la résistance aux antibiotiques : un nouveau besoin
M. bovis : vers une nouvelle génération de vaccins ?
M. agalactie : une perte de sensibilité aux antibiotiques très modérée
Les travaux en cours pour la résistance des autres espèces aux antibiotiques
CONCLUSION
1 photo illustre cet article
Florence Tardy
Florence Tardy est ingénieur (INSA) et docteur en Biochimie (Université de Lyon).
Elle a travaillé sur diverses thématiques de microbiologie successivement à l’Université Libre de Bruxelles, à l’Afssa (Lyon), à l’Institut scientifique de santé publique (Bruxelles) et dans une entreprise agroalimentaire.
1994 : Ingénieur INSA
1997 : Docteur en Biochimie
2011 : Habilitation à diriger les recherches
Depuis 2012 : Direction de l’UMR Mycoplasmoses des ruminants (Anses-VetAgro Sup)
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| Sauter Nº38, vol. 10, 2017Sauter sommaire
Test clinique - Diarrhée profuse chronique chez un taureau reproducteur Blond d’Aquitaine de 4 an
Laetitia Icher, Nicolas Herman, Marie-Noelle Lucas,
Enrico Martinelli, Hervé Cassard, François Schelcher,
Vincent Herry
Éditorial - Didier Calavas
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ACTUALITÉS EN PERSPECTIVE
- Émergence du virus de la fièvre catarrhale ovine (FCO)
à sérotype 4 en France continentale
Stéphan Zientara, Corinne Sailleau, Cyril Viarouge,
Emmanuel Bréard
Chronique - Le Règlement européen sur la maladies animales transmissibles se précise
Zénon
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RUMINANTS
Dossier : Les mycoplasmoses chez les ruminants
- Les principales évolutions dans la connaissance des mycoplasmes des ruminants conséquences en matière de diagnostic et de surveillance
Florence Tardy, Patrice Gaurivaud, Chloé Ambroset,
Xavier Nouvel, Christine Citti
- Les mycoplasmes dans les syndromes respiratoires
chez le veau et le jeune bovin adulte
Claire Becker, Renaud Maillard, Sébastien Assié,
François Poumarat, Florence Tardy, Marie-Anne Arcangioli
- Fiche - Mycoplasma bovis symptômes et lésions
Claire Becker, Renaud Maillard, Sébastien Assié,
François Poumarat, Florence Tardy, Marie-Anne Arcangioli
- Fiche - Comment diagnostiquer M. bovis
Claire Becker, Renaud Maillard, Sébastien Assié,
François Poumarat, Florence Tardy, Marie-Anne Arcangioli
- Péripneumonie contagieuse bovine et pleuropneumonie contagieuse caprine situation mondiale, risque et surveillance
en France
Patrice Gaurivaud, Lucia Manso-Silvan, François Poumarat,
Pascal Hendrikx, François Thiaucourt, Florence Tardy
- L’Agalactie Contagieuse Caprine en France : situation épidémiologique nationale mesures prophylactiques
Dominique Le Grand, Jaquemine Vialard, Michael Treilles,
Florence Tardy, François Poumarat
- Thérapeutique : évolution de l’antibiorésistance des mycoplasmes responsables de l'Agalactie Contagieuse Caprine (hors M. agalactiae)
François Poumarat, Jaquemine Vialard, Dominique Le Grand, Florence Tardy
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VOLAILLES
- Que craindre des entérocoques dans la filière volaille ?
Mathieu Pinson, Benoît Sraka
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COMPRENDRE ET AGIR
- Cas pratiques de nutrition - Ration hivernale à base de foins pour vaches laitières
Francis Enjalbert
- Parasitologie - ”Jeunes bovins verts” et infestation
par Parafilaria bovicola : enquête cas-témoin en élevage
Julien Enfrein, Nicolas Oudot, Anne Lehébel, Nadine Brisseau, Christophe Chartier
- Nutrition - Les phyto-œstrogènes et l’alimentation des ovins
quelle influence sur la reproduction ?
Xavier Nouvel
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| Test clinique - Les réponses
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