Lors d’injection intra-articulaire, la complication la plus préoccupante est l’arthrite septique. On l'identifie à l’apparition d’une boiterie grave associée à des signes locaux tels qu’une distension articulaire importante et une hyperthermie.

Le pronostic sportif de l’animal est souvent réservé, même si un traitement adéquat est mis en place rapidement. Ainsi, l’application systématique de règles d’asepsie strictes, avec tonte et désinfection chirurgicale de la région est impérative, de même que l’utilisation de gants stériles et d’un matériel stérile à usage unique.

De plus, une mise au repos du cheval de 2 à 3 jours avec des sorties au pas, suivie d’une reprise progressive du travail est préconisée, quelle que soit la molécule administrée. Ce programme est à moduler en fonction de l’articulation concernée et du type de lésion présente.